Основан в 1951 году. В то время Ботанический сад занимал 14 га и первым его директором стал Михаил Иванов. Территория парка состояла из нескольких зон: ботанические экспозиции, парковая часть, питомники, коллекционные и экспериментальные участки, защитные насаждения. В первое же десятилетие была создана инфраструктура Ботанического сада (лаборатории для студентов, оранжереи, парники, дороги, водопровод) и собрана коллекция материалов для «заселения» парка. В 1994 году территория парка составляла уже 367 га и на его территории велись серьезные научные исследовательские изыскания, проводились практики для студентов, велась экологическая и просветительская деятельность для учителей и школьников.
Ботанический сад ПетрГУ расположен на территории характерной для Карелии террасной структуры, образованной во времена сейсмической активности в послеледниковый период. На территории парка существует 3 отдела: азиатской, американской и европейской флоры. Ботанический сад на настоящий момент – это красивейшее место. Посаженные полвека назад саженцы превратились в крепкие высокие деревья, которых насчитывается сейчас порядка 300 видов и которые формируют растительные сообщества подобные природным. Кроме того, на территории парка научными сотрудниками и студенатами все эти годы велись исследования по разным направлениям – высаживалась и изучалась «карельская береза», лекарственные травы Карелии, создан декоративный арборетрум, где собраны такие непривычные для Карелии породы как туя, спирей, барбарис наравне с можжевельником, остролистным кленом, был создан плодовый сад, где выведены зимостойкие яблони, пригодные для условий Карелии сорта малины, облепихи, смородины, крыжовника. Конечно, есть в ботаническом саду и цветочно-декоративные растения, которые яркими красками украшают его с весны до осени, есть «Теневой сад» и «Солнечный сад» (в первом поселились тенелюбивые, а во втором солнцелюбивые растения).
Также в составе флоры Ботанического сада – 9 видов растений, занесенных в Красную книгу Карелии (2008 г.), и 38 – в Красную книгу Восточной Фенноскандии (1998 г.).В 2011 году на территории парка был реализован ландшафтные проект «Языческая поляна» под руководством Ю.П. Фефилатьева. Поляна представляет из себя мини-копию древних саамских лабиринтов. Благодаря реализации этого проекта, неподалеку от столицы Карелии появился целый комплекс достопримечательностей - Ботанический сад с его богатейшим разнообразием представленной растительности, геологический памятник - "Чертов стул" и мини-копия саамского лабиринта. Все это расположено в 20 минутах от центра Петрозаводска, на берегу Петрозаводской губы Онежского озера. Добраться туда можно на такси или маршрутке (по состоянию на 2011 год – маршрут №4 и №8). По пути можно будет полюбоваться на восстановленную церковь Сретения Господня в Соломенном, проехать по понтонному мосту и увидеть панораму Петрозаводска.
Время работы Ботанического сада ПетрГУ с 9.00 до 17.00.
